Кубок Германии: 1957, 1966, 1967, 1969, 1971, 1982, 1984,1986, 1998, 2000, 2003, 2005, 2006

Кубок Германской Лиги: 1997, 1998, 1999, 2000, 2004, 2007

Супер Кубок Германии: 1982, 1987, 1990

Лига Чемпионов: 1974, 1975, 1976, 2001

Кубок Уефа: 1996

Кубок Обладателей Кубков: 1967

Межконтинентальный Кубок: 1976, 2001

История берет свое начало с февраля 1900 года и связана с именем берлинца Франца Джона и 18 людьми, которые стали первыми из многочисленных игроков клуба. Восхождение клуба началось в 1907 году, когда баварцы переехали в Баварию, а именно – в Мюнхен, на улицу Леопольдштрассе. Местная команда ФК Ваккер первой испытала на себе грядущую силу клуба, проиграв баварцам – 1:8.

Первый успех Баварии – высшее место в мюнхенском футболе, но первым существенным достижением стало чемпионство в Восточном регионе в 1910 году.

В следующем году Бавария защитила свой титул. К тому времени, в рядах клуба играл член национальной сборной. Макс Габлонски, по прозвищу "Габерль", впервые примерил футболку сборной в матче с бельгийцами 16 мая 1910 года, закончившемся поражением 0-3. Вскоре после этого, дела быстро пошли в гору. К 1920 году, Бавария имела в своем распоряжении около 700 членов клуба и стала тем, чем является сейчас – крупнейшим футбольным клубом Мюнхена.

В 1926 году команда выиграла чемпионат Южной Германии, а в 1932 году добилась победы в чемпионате страны, обыграв франкфуртский Айнтрахт – 2:0. В том матче отличились Рор и Крумм, звездами команды были Хайдкампф и Брайндль, а тренером, массажистом, организатором и менеджером в одном лице – Рихард Домби, по прозвищу "Малыш".

Бавария стала известной всей Германии, но после того, как Симетсрайтер, Гольдбруннер и Молль в 1936 году усилили собой олимпийскую сборную Германии, в команде умер футбольный дух. Вскоре разразилась вторая мировая война и спорт в Германии остановился на многие годы.

Президенты

Франц Джон: 1900-1903
Dr. Уилем Хесселинк: 1903-1906
Курт Мюллер: 1906-1907
Dr. Анджело Кнорр: 1907-1913
Курт Ландауэр: 1913-1914
Фред Дан: 1914-1915
Ханс Туш: 1915
Фриц Майер: 1915
Ханс Бермюллер: 1916
Фриц Майер: 1916-1919
Курт Ландауэр: 1919-1921
Фред Дан: 1921-1922
Курт Ландауэр: 1922-1933
Зигфрид Херманн 1933-1934
Dr. Карл-Хайнц Оттингер: 1934-1935
Dr. Рихард Амесмайер: 1935-1937
Франц Нуссхард: 1937-1938
Кельнер: 1938-1943
Заутер: 1943-1945
Франц Ксавер Хайлмасендер, Йозеф Байер: 1945
Зигфрид Херманн: 1945-1947
Курт Ландауэр: 1947-1951
Джулиус Шеринг: 1951-1953
Адольф Фишер, Карли Вилд, Хюго Цисингер: 1953-1955
Альфред Рейтлингер: 1955-1958
Роланд Эндлер: 1958-1962
Вильхельм Нойдекер: 1962-1979
Вилли О. Хоффманн: 1979-1985
Prof. Dr. Фриц Шерер: 1986-1994
Франц Беккенбауэр: с 1994